El Programa Nacional de Becas y Crédito Educativo (PRONABEC) en coordinación con la Universidad Nacional Toribio Rodríguez de Mendoza de Amazonas vienen otorgando becas a estudiantes destacados en las distintas carreras profesionales de la universidad.

Pronabec, mediante una estrecha coordinación con la UNTRM, a la actualidad viene otorgando un total de 613 becas en sus diferentes modalidades: Beca Permanencia, Beca de Continuidad de Estudio, Beca 18 y Becas a hijos de docentes, todos con el mismo propósito de fomentar la educación y el desarrollo académico, en su sede central Chachapoyas, Filial Bagua y Filial Utcubamba.

La UNTRM y PRONABEC garantizan la continuidad de los estudiantes que finalizan el quinto año de secundaria a través de este tipo de programas, incentivando su desarrollo académico y facilitando su transición hacia la educación superior.